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"Austrian Proteomics Platform"; Projekt: Etablierung neuer Proteomics-Strategien in der Veterinärmedizin

Abstract
Moderne elektrophoretische Methoden, wie zweidimensionale Elektrophorese, stellen wertvolle Werkzeuge z.B. bei der Analyse von Körperflüssigkeiten dar und ermöglichen auch das Finden potentieller Marker für Erkrankungen. Im Laufe der letzten Jahre lag der Schwerpunkt unserer Arbeit auf der Erstellung von 2-DE Referenzmustern von Seren unterschiedlicher Tierarten (Ratte, Hund, Schwein, Rind, Pferd), jetzt soll in einem nächsten Schritt untersucht werden, wie sich diese Serumproteinmuster bei definierten Erkrankungen verändern. Zu diesem Zweck sollen neue und innovative Färbetechnologien (Fluoreszenzfärbung und DIGE) etabliert und angewendet werden. Bei DIGE (difference image gel electrophoresis) werden mit unterschiedlichen Fluoreszenzfarbstoffen markierte Proben gemischt und auf einem gemeinsamen Gel elektrophoretisch getrennt. Die je nach Farbstoff entsprechend gefilterten Bilder dieses Gels können miteinander verglichen werden. Diese Methode sollte - nach Optimierung - eine Vereinfachung und Verbesserung der bestehenden kolorimetrischen Färbeverfahren darstellen und einen etwas höheren Probendurchsatz erlauben.
Projektleitung
Duvigneau Catharina
Laufzeit
01.01.03-31.12.05
Art der Forschung
Angewandte Forschung
Beteiligte Vetmed-Organisationseinheiten
Institut für Medizinische Biochemie
(Weitere) Projektpartner
Karl-Franzens-Universität Graz, Graz, Österreich
Leopold-Franzens-Universität Innsbruck, Innrain 52, 6020 Innsbruck, Österreich
Research Institute of Molecular Pathology, Österreich
Gefördert durch
Bundesministerium für Bildung - Ö, Minoritenplatz 5, 1010 Wien, Österreich
12 Publikationen

Miller, I; Radwan, M; Strobl, B; Vogl, C; Mueller, M; Gemeiner, M (2005): Spot patterns of lysed mouse macrophages; What comes from cell culture medium. HUPO 4th Annual World Congress, Munich, Germany, August 28–September 1, 2005. Mol Cell Proteomics (4), 8S1 S230-S230.

Radwan, M; Miller, I; Strobl, B; O'Donoghue, N; Dunn, M; Vogl, C; Gemeiner, M; Müller, M (2006): The influence of Tyk2 deficiency on the murine macrophage proteome. Immunoregulatory and Antimicrobial Activities of Myeloid Cells, Freiburg, 05.-07.10.2006. Immunoregulatory and Antimicrobial Activities of Myeloid Cells, Freiburg, 05.-07.10.2006.

Miller, I; Crawford, J; Gianazza, E (2006): Protein stains for proteomic applications: which, when, why? Proteomics. 2006; 6(20):5385-5408

Miller, I (2006): Staining and quantification in proteomics: does the dye make a difference?. 4. Österreichisches Proteomforschungssymposium, Wien, Austria, 20.-21.09.2006. 4. Österreichisches Proteomforschungssymposium, Wien, 20.-21.09.2006.

Miller I; Crawford J; Gianazza E (2006): How variable is the pattern of a complex sample like serum when using different stains?. From genome to Proteome: Back to the future, Siena, Italien, Italy, 3.-7. September 2006. From genome to Proteome: Back to the future, Siena, Italien, 3.-7. September 2006.

Miller, I; Radwan, M; Strobl, B; Müller, M; Gemeiner, M (2006): Contribution of cell culture additives to the two-dimensional protein patterns of mouse macrophages. Electrophoresis. 2006; 27(8):1626-1629

Miller, I; Gemeiner, M; Gesslbauer, B; Kungl, A; Piskernik, C; Haindl, S; Nürnberger, S; Bahrami, S; Redl, H; Kozlov, AV (2006): Proteome analysis of rat liver mitochondria reveals a possible compensatory response to endotoxic shock. FEBS Lett (580), 5 1257-1262.
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Miller, I (2005): Proteomics und zweidimensionale Elektrophorese. 11. Österreichische Chemietage, Leoben, 19.-22.09.2005. 11. Österreichische Chemietage, Leoben, 19.-22.09.2005.

Miller, I; Gemeiner, M; Gesslbauer, B; Kungl, A; Staniek, K; Nohl, H; Haindl, S; Bahrami, S; Redl, H; Kozlov, A (2005): The proteome of rat liver mitochondria: protein pattern and mitochondrial function. Second International Symposium of the Austrian Proteomics Platform, Seefeld, 24.-27.01.2005. Second International Symposium of the Austrian Proteomics Platform, Seefeld, 24.-27.01.2005.

Miller, I; Fountoulakis, M; Duvigneau, C; Hartl, R; Dobretsberger, M; Sieber, K; Prosl, H; Gemeiner, M (2005): The plasma proteome of Equus caballus: patterns under baseline conditions and during anthelmintic treatment. 5th International Colloquium On Animal Acute Phase Proteins, Dublin, 14.-15.03.2005. 5th International Colloquium On Animal Acute Phase Proteins, Dublin, 14.-15.03.2005.

Miller, I (2004): Protein staining: colorimetric vs. fluorescent dyes. 2. Österreichisches Proteomforschungssymposium, Wien, Austria, 29.-30.09.2004. 2. Österreichisches Proteomforschungssymposium, Wien, 29.-30.09.2004.

Miller, I; Duvigneau, C; Hartl, R; Dobretsberger, M; Sieber, K; Prosl, H; Gemeiner, M (2004): Parasitic infection in horses: Serum protein pattern changes during infestation and treatment. First International Symposium of the Austrian Proteomics Platform, Seefeld, 26. - 29.01.2004. First International Symposium of the Austrian Proteomics Platform, Seefeld, 26. - 29.01.2004.

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