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Gewählte Publikation:

Publikationstyp: Zeitschriftenaufsatz
Dokumentart: Originalarbeit

Publikationsjahr: 2016

AutorInnen: Mann, E; Wetzels, SU; Pinior, B; Metzler-Zebeli, BU; Wagner, M; Schmitz-Esser, S

Titel: Psychrophile spoilers dominate the bacterial microbiome in musculature samples of slaughter pigs.

Quelle: Meat Sci. 2016; 117:36-40



Autor/innen der Vetmeduni Vienna:

Mann-Selberherr Evelyne
Metzler-Zebeli Barbara
Pinior Beate
Schmitz-Esser Stephan
Wagner Martin
Wetzels Stefanie

Beteiligte Vetmed-Organisationseinheiten
Institut für Lebensmittelsicherheit, Lebensmitteltechnologie und öffentliches Gesundheitswesen in der Veterinärmedizin, Abteilung für Lebensmittelmikrobiologie
Institut für Lebensmittelsicherheit, Lebensmitteltechnologie und öffentliches Gesundheitswesen in der Veterinärmedizin, Abteilung für Öffentliches Veterinärwesen und Epidemiologie
Institut für Tierernährung und funktionelle Pflanzenstoffe
Universitätsklinik für Schweine


Zugehörige(s) Projekt(e): d-i.INFLACOW: Characterization and prevention of diet-induced inflammation and related immune and metabolic disorders in dairy cows

Genetische und zytologische Grundlagen von "Cytoplasmic Incompatibility" in Cardinium

Charakterisierung der Darmmikrobiota beim Rind im Hinblick auf Lebensmittelqualität und Tiergesundheit


Abstract:
The aim of this study was to disentangle the microbial diversity on porcine musculature. The hypervariable V1-V2 region of the 16S rRNA gene was amplified from DNA samples of clinically healthy slaughter pigs (n=8). Pyrosequencing yielded 37,000 quality-controlled reads and a diverse microbiome with 54-159 OTUs per sample was detected. Interestingly, 6 out of 8 samples were strongly dominated by 1-2 highly abundant OTUs (best hits of highly abundant OTUs: Serratia proteamaculans, Pseudomonas syringae, Aeromonas allosaccharophila, Brochothrix thermosphacta, Acidiphilium cryptum and Escherichia coli). In 1g musculature scraping, 3.20E+06 16S rRNA gene copies and 4.45E+01 Enterobacteriaceae rRNA gene copies were detected with qPCR. We conclude that i.) next-generation sequencing technologies help encompass the full content of complex, bacterial contamination, ii.) psychrophile spoilers dominated the microbiota and iii.) E. coli is an effective marker species for pork contamination, as it was one of very few abundant species being present in all samples.


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